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| 二硒鍵或多對二硫鍵肽（Peptides with seleno-Cys，Multiple disulfide bonds (toxins, defensins, relaxins)） |
| 磷酸化修飾和磺酸化修飾（Sulfation） |
| 自組裝（self assembling）多肽 |
| 細胞穿膜肽 |
| 環化修飾 |
| N端（Lys側鏈）修飾 |
| C端修飾 |
| 單熒光標記 |
| 雙熒光標記（FRET) |
| 聚乙二醇修飾（PEGylation） |
| D型氨基酸及非天然氨基酸修飾 |
| 多肽蛋白偶聯 |
| MAPs復合抗原肽 |
| 同位素標記 |
| 大環螯合肽（Chelating Peptide） |
| 糖肽（Glycopeptides） |
| 點擊化學肽（clickable peptides） |